自然储存：将第一份玉米秸秆样品自然堆放，取样时距离表层40～50cm，每次取样在不同的位置，距上次取样处大约50cm。
桶装储存：将第二份玉米秸秆样品，封装于12个聚乙烯塑料桶内，每个桶的容积大约为0.9m3，压实后密封，秸秆储量200kg左右。封装要确保每个桶密闭，与外界空气基本隔绝，下部设计渗出液流出口。为防止储存过程中秸秆的霉变腐烂，另外增加三个备用桶装原料。在规定时间内，每次打开任意一个未启封的设备，取样位置在每个桶的正中间，即距表层40cm左右，距四周等距，原料取出后，该桶秸秆原料作废。
袋装储存：将第三份玉米秸秆样品封装于聚乙烯的塑料袋中。塑料袋分为两层，里面一层为编织袋，外面一层为不透气的聚乙烯塑料袋，每袋封装35 kg左右，封装要求与外界空气隔绝。样品的取用，从第二层开始，选取完好、不破损的袋装原料，从袋子中间选用样品，取样后该袋原料作废。
为了获得可靠的数据，应注意几个环节。储蒇方法尽可能接近规模化储存的实际，并要设对比试验项；取样是关键，抽取样品能够反映实际；以12个月为一个试验周期，每月在设定的时间取样检测，并记录对应的环境参数。
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